研究报告

金线兰黄酮相关基因的克隆与生物信息学分析  

陈莹1,2* , 潘王韵1 , 林思祖2*
1福建农林大学园林学院,福州, 350002; 2福建农林大学林学院,福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2018年11月20日    接受日期: 2018年11月27日    发表日期: 2020年06月17日
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摘要

为了对金线兰查尔酮合成酶 CHS和黄酮醇合成酶 FLS进行基因的克隆和生物学信息分析,本研究参照测序得到的金线兰CHSFLS基因的序列,设计特异性引物进行扩增。利用软件,对金线兰 CHSFLS蛋白的生物信息进行预测分析。结果显示,金线兰CHS基因的 CDS总长度 1 185 bp,编码 394个氨基酸,金线兰FLS基因的CDS总长度 1 035 bp,编码 344个氨基酸。金线兰CHS蛋白与FLS蛋白皆是酸性、亲水性、无信号肽、非分泌、非跨膜蛋白,亚细胞定位在其他细胞器上,丝氨酸磷酸化位点具有调控二者构象变化的重要作用。在 Blast上进行序列比对,发现金线兰CHS序列和FLS蛋白序列与一些兰科植物的相似度很高,前者序列同源性均高达 85%以上,后者同源性高达 82%81%,构建的进化树显示了他们较近的亲缘关系。推测得到的CHS序列即为金线兰查尔酮合成酶的编码序列,FLS蛋白序列即为金线兰黄酮醇合成酶的编码序列。本研究为进一步研究金线兰中黄酮相关基因及其调控提供一定参考。

关键词
金线兰(Anoectochilus roxburghii);查尔酮合成酶;黄酮醇合成酶;基因克隆;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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